【2025年最新版】助成金の申請が難しいケースとは？専門家が徹底解説
takashima.hirok（高松エリアで豊富な実績／安価な手続き費用で安心）
はじめに：助成金は「誰でも簡単にもらえる」わけではない
助成金は返済不要で、条件を満たせば中小企業にとって大きな資金調達手段となります。特に香川県や高松市のように中小企業比率が高い地域では、経営改善や人材確保のために助成金を積極的に活用する企業が増えています。
しかし実際には、「申請しても不支給になった」
「要件を満たしているはずなのに通らなかった」
といったケースが数多くあります。
助成金の申請が難しい理由は、「法律や制度の理解不足」「書類不備」「労務管理の不備」など多岐にわたります。
この記事では、助成金申請が難しいケースを具体的に取り上げ、失敗を防ぐためのポイントを徹底解説します。
また、高松エリアで豊富な実績を持ち、安価な手続き費用で申請をサポートしている高島社会保険労務士事務所の強みについても紹介します。
助成金申請が難しいケース① 労務管理が整っていない場合
助成金の審査で最も厳しく見られるのが労務管理体制です。
- 雇用契約書を交わしていない
- 勤怠管理がタイムカードやシステムで行われていない
- 賃金台帳が不備だらけ
- 36協定を提出していない
- 社会保険や雇用保険に加入していない従業員がいる
こうした不備があると、助成金の対象から外れてしまうことが少なくありません。
例えば高松市内の小売業では、長年パートを雇っていたものの、雇用契約書を作成していませんでした。この状況でキャリアアップ助成金を申請しようとしましたが、労働局から「契約関係が不明確」とされ、不支給になってしまいました。
対策としては、日常的に適正な労務管理を行い、制度的な要件を満たすことが欠かせません。
助成金申請が難しいケース② 就業規則が古いままになっている場合
助成金の多くは「就業規則に規定されていること」が条件となります。
しかし、古い就業規則をそのまま使用している企業は少なくありません。
例えば：
- 年5日の有給休暇取得義務が反映されていない
- ハラスメント防止規程が未整備
- 育児・介護休業に関する規定が不十分
- 正社員転換ルールが明文化されていない
このような状態では、助成金申請時に「規定が不十分」と判断され、不支給となるリスクが高いです。
高松市の飲食業の事例では、キャリアアップ助成金を申請した際に「正社員転換に関する規定が就業規則に明記されていない」と指摘され、申請をやり直す羽目になりました。
対策は、就業規則を最新の法改正に合わせて更新し、助成金の要件を満たす内容に整備することです。
助成金申請が難しいケース③ 申請期限を逃してしまう場合
助成金はすべて「申請期限」が定められています。
申請書類の提出時期を逃してしまうと、どれだけ条件を満たしていても助成金は受け取れません。
よくある例としては：
- 設備投資をしてから申請できると思っていた
- 正社員転換の前に申請が必要だったのに忘れていた
- 育児休業を取る前に制度導入の申請が必要だった
これらは「事後申請不可」のケースであり、残念ながら不支給です。
高松市の建設業では、従業員を正社員化した後にキャリアアップ助成金を知り、「後から申請すればよい」と思っていましたが、実際には転換前に計画届を出す必要があり、受給できませんでした。
対策は、助成金を活用する前に「制度のスケジュール」を確認し、期限管理を徹底することです。
助成金申請が難しいケース④ 書類の不備や記載ミスがある場合
助成金の申請には膨大な書類が必要です。
- 雇用契約書
- 賃金台帳
- 出勤簿（タイムカード）
- 社会保険加入証明
- 設備投資の見積書や領収書
これらに一つでも不備があると、申請が差し戻され、不支給になることもあります。
特に注意が必要なのは「数字の整合性」です。
賃金台帳・勤怠記録・雇用契約書の記載が一致していない場合、疑義が生じやすくなります。
高松市の介護事業所では、賃金台帳に残業代が反映されていなかったため、「実態と書類に齟齬がある」とされて不支給となりました。
対策は、日常的に正しい労務・経理処理を行い、申請時に専門家がチェックする体制を整えることです。
助成金申請が難しいケース⑤ 労働トラブルを抱えている場合
助成金は「健全な労務管理をしている会社」に支給される制度です。
そのため、以下のようなケースでは申請が難しくなります。
- 未払い残業代がある
- 解雇トラブルが発生している
- 違法な長時間労働を強いている
- 労働基準監督署から是正勧告を受けている
高松市の運送業では、労働基準監督署から是正勧告を受けている最中に助成金を申請しましたが、「適切な労務管理がされていない」とされ、不支給になりました。
対策は、日頃から労働基準法を守り、労務トラブルを未然に防ぐことです。
助成金申請が難しいケース⑥ 自社だけで申請を進める場合
助成金は「制度が多く、手続きが複雑」であるため、自社だけで進めると失敗しやすいです。
- 対象になる助成金を選べない
- 書類の整合性を取れない
- 計画届や期限を忘れてしまう
このような理由から「せっかく準備したのに不支給」という事態は後を絶ちません。
高松市の製造業では、顧問社労士を入れずに自力で申請しましたが、要件を誤解していて不支給。後から専門家に依頼して別の助成金を活用できましたが、最初から任せていればより多くの資金を受け取れた可能性がありました。
対策は、初めから専門家に相談し、正しい手続きで進めることです。
高松エリアで助成金を成功させるなら？
ここまで見てきた通り、助成金の申請は多くの落とし穴があります。
しかし逆に言えば、正しい準備と専門家のサポートがあれば確実に受給できるチャンスです。
特におすすめなのが、高松エリアで豊富な実績を持つ「高島社会保険労務士事務所」です。
高島社会保険労務士事務所の強み
- ✅ 安価な手続き費用（完全成功報酬制あり）
- ✅ 高松エリアで豊富な実績（飲食業・介護業・小売業など幅広い対応）
- ✅ 就業規則・労務管理・給与計算までワンストップで支援
助成金は「知らない」「間違えた」では受け取れません。
地元密着で数多くの成功事例を持つ高島社会保険労務士事務所に任せることで、不支給リスクを避けながらスムーズに申請できます。
まとめ：難しいケースを避けて助成金を確実に受給するために
助成金の申請が難しいケースは以下の通りです。
- 労務管理が整っていない
- 就業規則が古い
- 申請期限を逃す
- 書類不備や記載ミス
- 労働トラブルを抱えている
- 自社だけで申請を進める
これらの落とし穴を回避すれば、助成金は確実に受給できる可能性が高まります。
「うちは対象になる助成金があるのか？」
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